Cinsiyet kimliği bazen bedensel cinsiyet özellikleri nedeniyle kişiden beklenen cinsiyet ile örtüşmez. Bu örtüşmeme kişinin kendi cinsiyetiyle ilgili hoşnutsuzluk duymasına, daha da önemlisi kimliğini dışavurmasıyla damgalanma, ayrımcılık ve şiddete maruz kalmasına neden olabilir. Bedensel özelliklerle örtüşmemenin ötesinde, cinsiyet kimliği ve ifadesi bireyler arası geniş bir aralıkta değişkenlik göstermektedir. Kişilerin cinisyet kimliği ile ilgili başvurularında psikiyatrın rolü kişinin cinsel kimliğinin, cinsiyet kimliği dahil tüm boyutlarını toplumsal ve kendisinin içselleştirdiği önyargı ve kalıpyargılardan arınmış bir biçimde, yargılanmadığını bildiği bir ortamda keşfine, ifadesine, sorgulamasına imkan sağlanmasıdır. Kişinin talebi olduğunda cinsiyet geçiş süreci planı yapılmalıdır. Bu süreç kişinin bedensel, gelişimsel, ruhsal ve sosyal yönlerinin ayrıntılı bir şekilde gözden geçirilmesini gerektirmektedir.